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常見問題

Denovo、外顯子、轉(zhuǎn)錄組、miRNA等各種測序基本概念

答:Denovo測序:稱之為從頭測序,其不需要任何現(xiàn)有的序列資料就可以對某個物種進(jìn)行測序,利用生物信息學(xué)分析手段對序列進(jìn)行拼接,組裝,從而獲得該物種的基因組圖譜。 外顯子測序(Whole exon sequencing):利用序列捕獲技術(shù)將基因組外顯子區(qū)域DNA捕獲并富集后進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法。外顯子測序相對于基因組測序成本較低,對研究已知基因的SNP、Indel等具有較大的優(yōu)勢,但無法研究基因組結(jié)構(gòu)變異如染色斷裂重組等。 轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq):轉(zhuǎn)錄組是在基因組學(xué)后新興的一門學(xué)科,即研究特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA(包括mRNA和非編碼RNA)的類型和拷貝數(shù)?梢苑治龌虮磉_(dá)、cSNP、全新的轉(zhuǎn)錄、全新異構(gòu)體、剪接位點、等位基因特異性表達(dá)和罕見轉(zhuǎn)錄等最全面的轉(zhuǎn)錄組信息。 miRNA測序:成熟的microRNA是17-24nt的單鏈非編碼RNA分子,通過與mRNA相互作用影響目標(biāo)mRNA的穩(wěn)定性及翻譯,最終誘導(dǎo)基因沉默,調(diào)控著基因表達(dá)、細(xì)胞生長、發(fā)育等生物學(xué)過程。基于第二代測序技術(shù)的microRNA測序,可以一次性獲得數(shù)百萬條microRNA序列,能夠快速鑒定出不同組織、不同發(fā)育階段、不同疾病狀態(tài)下已知和未知的microRNA及其表達(dá)差異。

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